Налоговая напоминает на своем портале: при признании ведомством молча право компании на УСН оно не имеет права по результатам выездной проверки перевести фирму на ОСНО.
Налоговая в связи с этим привела старый пример решения ВС по этому вопросу. Компания была на УСН с 2006 года, далее единственным участником стало другое ЮЛ, и право на упрощенку было утрачено. Снова получить его удалось с 2013 года. Уведомление о переходе компания не отправила и сразу стала использовать упрощенный спецрежим. ФНС спокойно принимала декларации, получала все платежи, то есть ведомство как бы одобрило переход компании.
В 2016 году ФНС вдруг известила компанию о ее ошибке: из-за того что субъект не подал уведомление, он не имеет права применять УСН. Провели выездную проверку, были доначислены налоги по ОСНО. Арбитражные суды встали на сторону ФНС, поскольку пп. 19 п. 3 ст. 346.12 НК содержит запрет на применение упрощенки, если нет уведомления.
Однако ВС принял иное решение, встав на сторону компании. Суд отметил, что требовать декларации по ОСНО следовало бы раньше. В результате вышло так, что организации нужно платить недоимки за 3 года задним числом. ФНС просто несвоевременно отреагировала.
Также суд сообщил, что уведомление о переходе на упрощенку не означает, что выдано разрешение на этот спецрежим или оформлен запрет. Оно носит уведомительный характер.
ВС подчеркнул, что принудительный перевод организации с упрощенки на ОСНО по итогам выездной проверки не может быть самостоятельной задачей налогового контроля. Это указано в определении от 2 июля 2019 года № 310-ЭС19-1705 по делу № А62-5153/2017).